یکی از داستان‌های پرجنجال مرتبط با علی‌اکبر ولایتی، نماینده خامنه‌ای در شورای راهبردی روابط خارجی، انتخاب او برای ریاست غیرقانونی هیئت موسس دانشگاه آزاد اسلامی در بهمن‌ماه سال ۱۳۹۵ است. این انتصاب با نقض شرایط اساسنامه دانشگاه آزاد همراه بود. بر اساس این شرایط، این اعضای هیئت امنا بودند که وظیفه نامزد کردن و به رأی گذاشتن رئیس هیئت موسس را داشتند. اما خامنه‌ای این شرایط را نادیده گرفت و علی‌اکبر ولایتی را بدون رضایت هیئت امنا و رأی آن‌ها انتخاب کرد و بر کرسی ریاست نشاند. به هر حال ولایتی یکی از نزدیک‌ترین افراد به رهبر معظم انقلاب است. در نتیجه، این رئیس مرکز تحقیقات استراتژیک مجمع تشخیص مصلحت نظام، دارای پشتوانه‌ی بزرگی است. پشتوانه‌ای که معمولا محکم‌ترین، ثابت‌ترین و بی‌خطرترین موقعیت در رژیم اسلامی را برای فرد حمایت‌شده فراهم می‌کند. هنگامی که ولایتی، مشهور به «ابولمشاغل» یا پدر پیشه‌ها، بر صندلی ریاست هیئت موسس دانشگاه آزاد اسلامی نشست، رئیس دانشگاه...